SOX17

SOX17
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2YUL, 4A3N
Ідентифікатори
Символи	SOX17, VUR3, SRY-box 17, SRY-box transcription factor 17
Зовнішні ІД	OMIM: 610928 MGI: 107543 HomoloGene: 7948 GeneCards: SOX17
Онтологія гена
Молекулярна функція	• специфічне до послідовності зв'язування з ДНК; • зв'язування з ДНК; • зв'язування β-катеніну; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001105 transcription coactivator activity; • зв'язування з фактором транскрипції; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • активність гетеродимеризації білків; • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• регуляторний транскрипційний комплекс; • нуклеоплазма; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• розвиток ниркової системи; • endoderm development; • regulation of embryonic development; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • GO:1903364 positive regulation of protein catabolic process; • stem cell fate specification; • positive regulation of skeletal muscle tissue development; • embryonic foregut morphogenesis; • embryonic organ development; • endodermal digestive tract morphogenesis; • negative regulation of mesodermal cell fate specification; • inner cell mass cellular morphogenesis; • negative regulation of Wnt signaling pathway; • protein stabilization; • endocardium formation; • outflow tract morphogenesis; • signal transduction involved in regulation of gene expression; • endodermal cell fate determination; • mRNA transcription by RNA polymerase II; • regulation of mesodermal cell fate specification; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • Wnt; • endocardial cell differentiation; • regulation of cardiac cell fate specification; • ДНК-матрична транскрипція; • stem cell differentiation; • embryonic heart tube development; • васкулогенез; • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна; • heart looping; • cardiac cell fate determination; • common bile duct development; • negative regulation of Wnt signaling pathway involved in heart development; • rostrocaudal neural tube patterning; • GO:1901313 positive regulation of gene expression; • cardiogenic plate morphogenesis; • heart formation; • embryonic heart tube morphogenesis; • negative regulation of cell growth; • protein destabilization; • Ангіогенез; • Сперматогенез; • positive regulation of cell differentiation; • regulation of stem cell division; • гаструляція; • gall bladder development; • canonical Wnt signaling pathway; • регуляція диференціювання клітин; • cell migration involved in gastrulation; • endoderm formation; • regulation of stem cell proliferation; • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • cellular response to leukemia inhibitory factor; • диференціація клітин;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	64321
	20671
	ENSG00000164736
	ENSMUSG00000025902
	Q9H6I2
	Q61473
	NM_022454
	NM_001289464; NM_001289465; NM_001289466; NM_001289467; NM_011441
	NP_071899
	NP_001276393; NP_001276394; NP_001276395; NP_001276396; NP_035571
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SOX17 (англ. SRY-box 17) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 414 амінокислот, а молекулярна маса — 44 117^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSSPDAGYAS	DDQSQTQSAL	PAVMAGLGPC	PWAESLSPIG	DMKVKGEAPA
NSGAPAGAAG	RAKGESRIRR	PMNAFMVWAK	DERKRLAQQN	PDLHNAELSK
MLGKSWKALT	LAEKRPFVEE	AERLRVQHMQ	DHPNYKYRPR	RRKQVKRLKR
VEGGFLHGLA	EPQAAALGPE	GGRVAMDGLG	LQFPEQGFPA	GPPLLPPHMG
GHYRDCQSLG	APPLDGYPLP	TPDTSPLDGV	DPDPAFFAAP	MPGDCPAAGT
YSYAQVSDYA	GPPEPPAGPM	HPRLGPEPAG	PSIPGLLAPP	SALHVYYGAM
GSPGAGGGRG	FQMQPQHQHQ	HQHQHHPPGP	GQPSPPPEAL	PCRDGTDPSQ
PAELLGEVDR	TEFEQYLHFV	CKPEMGLPYQ	GHDSGVNLPD	SHGAISSVVS
DASSAVYYCN	YPDV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, її регуляція, сигнальний шлях Wnt. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Katoh M. (2002). Molecular cloning and characterization of human SOX17. Int. J. Mol. Med. 9: 153—157. PMID 11786926

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18122 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017. [Архівовано 2017-09-15 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q9H6I2 (англ.) . Архів оригіналу за 11 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 8

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18122 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017. [Архівовано 2017-09-15 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, Q9H6I2 (англ.) . Архів оригіналу за 11 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]