HOXD4

HOXD4
Ідентифікатори
Символи	HOXD4, HHO.C13, HOX-5.1, HOX4, HOX4B, Hox-4.2, homeobox D4
Зовнішні ІД	OMIM: 142981 MGI: 96208 HomoloGene: 7773 GeneCards: HOXD4
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • специфічне до послідовності зв'язування з ДНК • зв'язування з ДНК • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • міжклітинні контакти Біологічний процес • ДНК-матрична транскрипція • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • розвиток багатоклітинного організму • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • skeletal system development • anterior/posterior pattern specification • embryonic skeletal system morphogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3233	15436
Ensembl	ENSG00000170166	ENSMUSG00000101174
UniProt	P09016	P10628
RefSeq (мРНК)	NM_014621	NM_010469
RefSeq (білок)	NP_055436	NP_034599
Локус (UCSC)	Хр. 2: 176.15 – 176.15 Mb	Хр. 2: 74.54 – 74.56 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HOXD4 (англ. Homeobox D4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 255 амінокислот, а молекулярна маса — 27 885.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVMSSYMVNS		KYVDPKFPPC		EEYLQGGYLG		EQGADYYGGG		AQGADFQPPG
LYPRPDFGEQ		PFGGSGPGPG		SALPARGHGQ		EPGGPGGHYA		APGEPCPAPP
APPPAPLPGA		RAYSQSDPKQ		PPSGTALKQP		AVVYPWMKKV		HVNSVNPNYT
GGEPKRSRTA		YTRQQVLELE		KEFHFNRYLT		RRRRIEIAHT		LCLSERQIKI
WFQNRRMKWK		KDHKLPNTKG		RSSSSSSSSS		CSSSVAPSQH		LQPMAKDHHT
DLTTL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 2