PHF10

PHF10
Ідентифікатори
Символи	PHF10, BAF45A, XAP135, PHD finger protein 10, SMARCG4
Зовнішні ІД	OMIM: 613069 MGI: 1919307 HomoloGene: 10112 GeneCards: PHF10
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми • зв’язування з іоном металу • histone acetyltransferase activity • GO:0031493 histone binding Клітинна компонента • клітинне ядро • npBAF complex • histone acetyltransferase complex Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • ДНК-матрична транскрипція • нейробіологія розвитку • histone acetylation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55274	72057
Ensembl	ENSG00000130024	ENSMUSG00000023883
UniProt	Q8WUB8	Q9D8M7
RefSeq (мРНК)	NM_133325 NM_018288	NM_024250 NM_001360983
RefSeq (білок)	NP_060758 NP_579866	NP_077212 NP_001347912
Локус (UCSC)	Хр. 6: 169.7 – 169.73 Mb	Хр. 17: 15.17 – 15.18 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PHF10 (англ. PHD finger protein 10) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 498 амінокислот, а молекулярна маса — 56 051.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAAAGPGAA		LSPRPCDSDP		ATPGAQSPKD		DNEDNSNDGT		QPSKRRRMGS
GDSSRSCETS		SQDLGFSYYP		AENLIEYKWP		PDETGEYYML		QEQVSEYLGV
TSFKRKYPDL		ERRDLSHKEK		LYLRELNVIT		ETQCTLGLTA		LRSDEVIDLM
IKEYPAKHAE		YSVILQEKER		QRITDHYKEY		SQMQQQNTQK		VEASKVPEYI
KKAAKKAAEF		NSNLNRERME		ERRAYFDLQT		HVIQVPQGKY		KVLPTERTKV
SSYPVALIPG		QFQEYYKRYS		PDELRYLPLN		TALYEPPLDP		ELPALDSDGD
SDDGEDGRGD		EKRKNKGTSD		SSSGNVSEGE		SPPDSQEDSF		QGRQKSKDKA
ATPRKDGPKR		SVLSKSVPGY		KPKVIPNAIC		GICLKGKESN		KKGKAESLIH
CSQCENSGHP		SCLDMTMELV		SMIKTYPWQC		MECKTCIICG		QPHHEEEMMF
CDMCDRGYHT		FCVGLGAIPS		GRWICDCCQR		APPTPRKVGR		RGKNSKEG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, нейрогенез, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

• Banga S.S., Peng L., Dasgupta T., Palejwala V., Ozer H.L. (2009). PHF10 is required for cell proliferation in normal and SV40-immortalized human fibroblast cells. Cytogenet. Genome Res. 126: 227—242. PMID 20068294 doi:10.1159/000251960
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 6