SALL2

SALL2
Ідентифікатори
Символи	SALL2, COLB, HSAL2, Sal-2, ZNF795, p150(Sal2), spalt-like transcription factor 2, spalt like transcription factor 2
Зовнішні ІД	OMIM: 602219 MGI: 1354373 HomoloGene: 9269 GeneCards: SALL2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • специфічне до послідовності зв'язування з ДНК • зв'язування з ДНК • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми • зв’язування з іоном металу • зв'язування з нуклеїновими кислотами • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0032403 protein-containing complex binding Клітинна компонента • NuRD complex • клітинне ядро Біологічний процес • розвиток ока • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • neural tube development • GO:0072468 сигнальна трансдукція • ДНК-матрична транскрипція • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6297	50524
Ensembl	ENSG00000165821	ENSMUSG00000049532
UniProt	Q9Y467	Q9QX96
RefSeq (мРНК)	NM_001291446 NM_001291447 NM_005407 NM_001364564	NM_001244916 NM_015772
RefSeq (білок)	NP_001278375 NP_001278376 NP_005398 NP_001351493	NP_001231845 NP_056587
Локус (UCSC)	Хр. 14: 21.52 – 21.54 Mb	Хр. 14: 52.55 – 52.57 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SALL2 (англ. Spalt like transcription factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 007 амінокислот, а молекулярна маса — 105 309.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSRRKQRKPQ		QLISDCEGPS		ASENGDASEE		DHPQVCAKCC		AQFTDPTEFL
AHQNACSTDP		PVMVIIGGQE		NPNNSSASSE		PRPEGHNNPQ		VMDTEHSNPP
DSGSSVPTDP		TWGPERRGEE		SPGHFLVAAT		GTAAGGGGGL		ILASPKLGAT
PLPPESTPAP		PPPPPPPPPP		GVGSGHLNIP		LILEELRVLQ		QRQIHQMQMT
EQICRQVLLL		GSLGQTVGAP		ASPSELPGTG		TASSTKPLLP		LFSPIKPVQT
SKTLASSSSS		SSSSSGAETP		KQAFFHLYHP		LGSQHPFSAG		GVGRSHKPTP
APSPALPGST		DQLIASPHLA		FPSTTGLLAA		QCLGAARGLE		ATASPGLLKP
KNGSGELSYG		EVMGPLEKPG		GRHKCRFCAK		VFGSDSALQI		HLRSHTGERP
YKCNVCGNRF		TTRGNLKVHF		HRHREKYPHV		QMNPHPVPEH		LDYVITSSGL
PYGMSVPPEK		AEEEAATPGG		GVERKPLVAS		TTALSATESL		TLLSTSAGTA
TAPGLPAFNK		FVLMKAVEPK		NKADENTPPG		SEGSAISGVA		ESSTATRMQL
SKLVTSLPSW		ALLTNHFKST		GSFPFPYVLE		PLGASPSETS		KLQQLVEKID
RQGAVAVTSA		ASGAPTTSAP		APSSSASSGP		NQCVICLRVL		SCPRALRLHY
GQHGGERPFK		CKVCGRAFST		RGNLRAHFVG		HKASPAARAQ		NSCPICQKKF
TNAVTLQQHV		RMHLGGQIPN		GGTALPEGGG		AAQENGSEQS		TVSGAGSFPQ
QQSQQPSPEE		ELSEEEEEED		EEEEEDVTDE		DSLAGRGSES		GGEKAISVRG
DSEEASGAEE		EVGTVAAAAT		AGKEMDSNEK		TTQQSSLPPP		PPPDSLDQPQ
PMEQGSSGVL		GGKEEGGKPE		RSSSPASALT		PEGEATSVTL		VEELSLQEAM
RKEPGESSSR		KACEVCGQAF		PSQAALEEHQ		KTHPKEGPLF		TCVFCRQGFL
ERATLKKHML		LAHHQVQPFA		PHGPQNIAAL		SLVPGCSPSI		TSTGLSPFPR
KDDPTIP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 14