TFAP4

TFAP4
Ідентифікатори
Символи	TFAP4, AP-4, bHLHc41, transcription factor AP-4 (activating enhancer binding protein 4), transcription factor AP-4
Зовнішні ІД	OMIM: 600743 MGI: 103239 HomoloGene: 2424 GeneCards: TFAP4
Онтологія гена Молекулярна функція • sequence-specific DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • гомодимеризація білків • protein dimerization activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • histone deacetylase binding • активність гетеродимеризації білків • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми • зв'язування з ДНК • E-box binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity Клітинна компонента • transcription repressor complex • клітинне ядро • мітохондрія Біологічний процес • негативна регуляція проліферації клітин • negative regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity • ДНК-матрична транскрипція • negative regulation of gene expression • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in transcription of p21 class mediator • cellular response to dexamethasone stimulus • negative regulation of DNA binding • positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic signaling pathway • позитивна регуляція апоптозу • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • regulation of mitotic cell cycle phase transition • GO:0034622 protein-containing complex assembly • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 регуляція транскрипції РНК-полімеразою II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7023	83383
Ensembl	ENSG00000090447	ENSMUSG00000005718
UniProt	Q01664	Q9JIZ5
RefSeq (мРНК)	NM_003223	NM_031182
RefSeq (білок)	NP_003214	NP_112459
Локус (UCSC)	Хр. 16: 4.26 – 4.27 Mb	Хр. 16: 4.36 – 4.38 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TFAP4 (англ. Transcription factor AP-4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 338 амінокислот, а молекулярна маса — 38 726.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEYFMVPTQK		VPSLQHFRKT		EKEVIGGLCS		LANIPLTPET		QRDQERRIRR
EIANSNERRR		MQSINAGFQS		LKTLIPHTDG		EKLSKAAILQ		QTAEYIFSLE
QEKTRLLQQN		TQLKRFIQEL		SGSSPKRRRA		EDKDEGIGSP		DIWEDEKAED
LRREMIELRQ		QLDKERSVRM		MLEEQVRSLE		AHMYPEKLKV		IAQQVQLQQQ
QEQVRLLHQE		KLEREQQQLR		TQLLPPPAPT		HHPTVIVPAP		PPPPSHHINV
VTMGPSSVIN		SVSTSRQNLD		TIVQAIQHIE		GTQEKQELEE		EQRRAVIVKP
VRSCPEAPTS		DTASDSEASD		SDAMDQSREE		PSGDGELP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Hu Y.-F., Luescher B., Admon A., Mermod N., Tjian R. (1990). Transcription factor AP-4 contains multiple dimerization domains that regulate dimer specificity. Genes Dev. 4: 1741—1752. PMID 2123466 doi:10.1101/gad.4.10.1741
• Ou S.H., Garcia-Martinez L.F., Paulssen E.J., Gaynor R.B. (1994). Role of flanking E box motifs in human immunodeficiency virus type 1 TATA element function. J. Virol. 68: 7188—7199. PMID 7933101

Див. також

• Хромосома 16