IRF2

IRF2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1IRF, 1IRG, 2IRF
Ідентифікатори
Символи	IRF2, IRF-2, interferon regulatory factor 2
Зовнішні ІД	OMIM: 147576 MGI: 96591 HomoloGene: 1659 GeneCards: IRF2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • зв'язування з ДНК; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • focal adhesion; • нуклеоплазма; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• interferon-gamma-mediated signaling pathway; • проліферація; • зсідання крові; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • type I interferon signaling pathway; • ДНК-матрична транскрипція; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription by RNA polymerase II; • процес імунної системи;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	3660
	16363
	ENSG00000168310
	ENSMUSG00000031627
	P14316
	P23906
	NM_002199
	NM_008391
	NP_002190
	NP_032417
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

IRF2 (англ. Interferon regulatory factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 349 амінокислот, а молекулярна маса — 39 354^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPVERMRMRP	WLEEQINSNT	IPGLKWLNKE	KKIFQIPWMH	AARHGWDVEK
DAPLFRNWAI	HTGKHQPGVD	KPDPKTWKAN	FRCAMNSLPD	IEEVKDKSIK
KGNNAFRVYR	MLPLSERPSK	KGKKPKTEKE	DKVKHIKQEP	VESSLGLSNG
VSDLSPEYAV	LTSTIKNEVD	STVNIIVVGQ	SHLDSNIENQ	EIVTNPPDIC
QVVEVTTESD	EQPVSMSELY	PLQISPVSSY	AESETTDSVP	SDEESAEGRP
HWRKRNIEGK	QYLSNMGTRG	SYLLPGMASF	VTSNKPDLQV	TIKEESNPVP
YNSSWPPFQD	LPLSSSMTPA	SSSSRPDRET	RASVIKKTSD	ITQARVKSC

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Itoh S., Harada H., Fujita T., Mimura T., Taniguchi T. (1989). Sequence of a cDNA coding for human IRF-2. Nucleic Acids Res. 17: 8372—8372. PMID 2813069 doi:10.1093/nar/17.20.8372
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Staal A., Enserink J.M., Stein J.L., Stein G.S., van Wijnen A.J. (2000). Molecular characterization of celtix-1, a bromodomain protein interacting with the transcription factor interferon regulatory factor 2. J. Cell. Physiol. 185: 269—279. PMID 11025449 doi:10.1002/1097-4652(200011)185:2<269::AID-JCP12>3.0.CO;2-L
Masumi A., Yamakawa Y., Fukazawa H., Ozato K., Komuro K. (2003). Interferon regulatory factor-2 regulates cell growth through its acetylation. J. Biol. Chem. 278: 25401—25407. PMID 12738767 doi:10.1074/jbc.M213037200
Childs K.S., Goodbourn S. (2003). Identification of novel co-repressor molecules for interferon regulatory factor-2. Nucleic Acids Res. 31: 3016—3026. PMID 12799427 doi:10.1093/nar/gkg431
Han K.-J., Jiang L., Shu H.-B. (2008). Regulation of IRF2 transcriptional activity by its sumoylation. Biochem. Biophys. Res. Commun. 372: 772—778. PMID 18514056 doi:10.1016/j.bbrc.2008.05.103

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6117 (англ.) . Архів оригіналу за 15 червня 2017. Процитовано 30 серпня 2017. [Архівовано 2017-06-15 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P14316 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 4

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6117 (англ.) . Архів оригіналу за 15 червня 2017. Процитовано 30 серпня 2017. [Архівовано 2017-06-15 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, P14316 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]