CDX2

CDX2
Ідентифікатори
Символи	CDX2, CDX-3, CDX2/AS, CDX3, caudal type homeobox 2, Cdx2
Зовнішні ІД	OMIM: 600297 MGI: 88361 HomoloGene: 968 GeneCards: CDX2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • зв'язування з ДНК • sequence-specific DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • зв’язування дволанцюгових ДНК • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • methyl-CpG binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding Клітинна компонента • transcription repressor complex • нуклеоплазма • condensed nuclear chromosome • клітинне ядро • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • pattern specification process • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of somitogenesis • somatic stem cell population maintenance • endosome to lysosome transport • placenta development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 регуляція транскрипції РНК-полімеразою II • labyrinthine layer development • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • ДНК-матрична транскрипція • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • розвиток багатоклітинного організму • blood vessel development • trophectodermal cell differentiation • establishment or maintenance of epithelial cell apical/basal polarity • positive regulation of cell differentiation • intestinal epithelial cell differentiation • positive regulation of cell population proliferation • animal organ morphogenesis • anterior/posterior axis specification • blastocyst development • anterior/posterior pattern specification Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1045	12591
Ensembl	ENSG00000165556	ENSMUSG00000029646
UniProt	Q99626	P43241
RefSeq (мРНК)	NM_001265 NM_001354700	NM_007673
RefSeq (білок)	NP_001256 NP_001341629	NP_031699
Локус (UCSC)	Хр. 13: 27.96 – 27.97 Mb	Хр. 5: 147.24 – 147.24 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CDX2 (англ. Caudal type homeobox 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 313 амінокислот, а молекулярна маса — 33 520.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MYVSYLLDKD		VSMYPSSVRH		SGGLNLAPQN		FVSPPQYPDY		GGYHVAAAAA
AAANLDSAQS		PGPSWPAAYG		APLREDWNGY		APGGAAAAAN		AVAHGLNGGS
PAAAMGYSSP		ADYHPHHHPH		HHPHHPAAAP		SCASGLLQTL		NPGPPGPAAT
AAAEQLSPGG		QRRNLCEWMR		KPAQQSLGSQ		VKTRTKDKYR		VVYTDHQRLE
LEKEFHYSRY		ITIRRKAELA		ATLGLSERQV		KIWFQNRRAK		ERKINKKKLQ
QQQQQQPPQP		PPPPPQPPQP		QPGPLRSVPE		PLSPVSSLQA		SVPGSVPGVL
GPTGGVLNPT		VTQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Drummond F.J., Putt W., Fox M., Edwards Y.H. (1997). Cloning and chromosome assignment of the human CDX2 gene. Ann. Hum. Genet. 61: 393—400. PMID 9459001 doi:10.1017/S0003480097006465
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Inamori K., Takeshita K., Chiba S., Yazaki Y., Hirai H. (1993). Identification of homeobox genes expressed in human T-lymphocytes. Biochem. Biophys. Res. Commun. 196: 203—208. PMID 8105782 doi:10.1006/bbrc.1993.2235

Див. також

• Хромосома 13