SIM2

SIM2
Ідентифікатори
Символи	SIM2, HMC13F06, HMC29C01, SIM, bHLHe15, single-minded family bHLH transcription factor 2, SIM bHLH transcription factor 2
Зовнішні ІД	OMIM: 600892 MGI: 98307 HomoloGene: 3716 GeneCards: SIM2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • активність гетеродимеризації білків • protein dimerization activity • зв'язування з ДНК • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • нуклеоплазма • ядерні тільця • клітинне ядро Біологічний процес • розвиток багатоклітинного організму • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 регуляція транскрипції РНК-полімеразою II • диференціація клітин • embryonic pattern specification • ДНК-матрична транскрипція • lung development • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6493	20465
Ensembl	ENSG00000159263	ENSMUSG00000062713
UniProt	Q14190	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_005069 NM_009586	NM_011377
RefSeq (білок)	NP_005060 NP_033664	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 21: 36.7 – 36.75 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SIM2 (англ. Single-minded family bHLH transcription factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 667 амінокислот, а молекулярна маса — 73 219.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKEKSKNAAK		TRREKENGEF		YELAKLLPLP		SAITSQLDKA		SIIRLTTSYL
KMRAVFPEGL		GDAWGQPSRA		GPLDGVAKEL		GSHLLQTLDG		FVFVVASDGK
IMYISETASV		HLGLSQVELT		GNSIYEYIHP		SDHDEMTAVL		TAHQPLHHHL
LQEYEIERSF		FLRMKCVLAK		RNAGLTCSGY		KVIHCSGYLK		IRQYMLDMSL
YDSCYQIVGL		VAVGQSLPPS		AITEIKLYSN		MFMFRASLDL		KLIFLDSRVT
EVTGYEPQDL		IEKTLYHHVH		GCDVFHLRYA		HHLLLVKGQV		TTKYYRLLSK
RGGWVWVQSY		ATVVHNSRSS		RPHCIVSVNY		VLTEIEYKEL		QLSLEQVSTA
KSQDSWRTAL		STSQETRKLV		KPKNTKMKTK		LRTNPYPPQQ		YSSFQMDKLE
CGQLGNWRAS		PPASAAAPPE		LQPHSESSDL		LYTPSYSLPF		SYHYGHFPLD
SHVFSSKKPM		LPAKFGQPQG		SPCEVARFFL		STLPASGECQ		WHYANPLVPS
SSSPAKNPPE		PPANTARHSL		VPSYEAPAAA		VRRFGEDTAP		PSFPSCGHYR
EEPALGPAKA		ARQAARDGAR		LALARAAPEC		CAPPTPEAPG		APAQLPFVLL
NYHRVLARRG		PLGGAAPAAS		GLACAPGGPE		AATGALRLRH		PSPAATSPPG
APLPHYLGAS		VIITNGR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Osoegawa K., Okano S., Kato Y., Nishimura Y., Soeda E. (1996). A 19-kb CpG island associated with single-minded gene 2 in Down syndrome chromosomal region. DNA Res. 3: 175—179. PMID 8905236 doi:10.1093/dnares/3.3.175
• Yamaki A., Kudoh J., Shimizu N., Shimizu Y. (2004). A novel nuclear localization signal in the human single-minded proteins SIM1 and SIM2. Biochem. Biophys. Res. Commun. 313: 482—488. PMID 14697214 doi:10.1016/j.bbrc.2003.11.168

Див. також

• Хромосома 21