Biota

Biota^[1] in scientificis classificationis rationibus sunt res quae ad caput totius taxinomiae viventium stant. Pan-Biota appellatur cladus phylogeneticus qui vitam ab initio usque ad homines comprehendit. Sic definitur ab ipso Wagner: "Hominis sapientis progenitor omniumque eius prolum".^[2] Idem cladus secundum regulas phylogeneticas recentiores in "Pan-Biota (Wagner, 2004)" a Queiroz et al. (2020) rite rescripta est, definitione emendata.

De nomine

Biota est vocabulum originis recentis, in lingua Anglica a biot- ('vita') et suffixo -a factum, sed similis est voci Graeco βιοτή, synonymo βίος, "vita".^[3]

Synonymum huius notionis est Bionta, nunc taxon defunctum habitum, a Lee Barker Walton anno 1930 excogitatum, ad omnia viventia denominanda, quod in tria subregna divisa erat: Protistodeas, Metaphytodeas (plantas multicellulares), et Zoodeas (animalia multicellularia).

Index taxinomicus et exempla vitae

Imperium: Vira (virus: est parasitus intracellularis, dubium est an animal sit)
Imperium: Cellulata

Superregio: Bacteria

Regio: Bacteria (utraque supra Eubacteria sunt, olim: Procaryota / Monera?)

Superregio: Archocaryota^[4]

Regio^[5]: Archaea / Archaebacteria

Regio: Eucaryota (qui nucleum habent in cellulis)

Subregio: Uniconta / Sarcomastigota (qui flagellum habent, ut: Eumycota, Amoebozoa, Choanozoa, Metazoa,...)

Infraregio: Opisthoconta (qui flagello propelluntur, vide regna: Fungi & Animalia)

Subregio: Biconta / Biciliata (vide infra: Chromalveolata, Excavata, Rhizaria, Archaeplastida, Apusozoa?)

Regna

Regna: Protista (Archae-/ Protozoa, Protophyta), Fungi, Chromista?, Plantae & Animalia
(Supergreges: Amoebozoa, Archaeplastida, Chromalveolata, Excavata, Opisthoconta & Rhizaria)

Regnum: Protista

Regnum: Protista (qui plurimum unam cellulam habent: plancton)
Subregnum: Gymnomyxa (Lancester 1878), Protozoa, Archaezoa (obsol.)
Subregnum: Sarcomastigota (=Uniconta?)
- (Phylum: Choanozoa (Cavalier-Smith 1981/83) / Neomonada (Cavalier-Smith, 1997)
  - Phylum: Sarcomastigophora (=Flagellata + Rhizopoda)
  - Superclassis: Mastigophora / Flagellata
    - Classis: Zoomastigophorea / Zoomastigina (Honigberg et al., 1964)
      - Ordo: Cryptomonadina, Trichomonadida, etc.
      - Ordo: Choanoflagellida
      - Ordo: Dinoflagellata (Phylum: Dinozoa?)
      - Ordo: Euglenida / Euglenoidina (euglena) (Phylum: Euglenozoa?)
      - Ordo: Cinetoplastida
      - Ordo: Oxymonadida
      - Ordo: Rhizomastigida, Hypermastigida etc.
- Phylum: Rhizopoda / Sarcodina / Amoebozoa (Cavalier-Smith 1998, olim: regnum Archezoa)
- (Pseudophylum Rhizopoda etiam continet Pseudopodia ut: Foraminifera, Heliozoa, Radiolaria)
  - Subphylum / Grex: Lobosa (Carpenter 1861 stat. nov. Cavalier-Smith 1997 em.)
    - Classis: Tubulinea:
      - Ordo: Amoebida / Amoebina (amoeba)
    - Classis: & Flabellinea
      - Ordo: Testacea (Thecamoeba?)
  - Subphylum / Grex: Conosa
  - Infraphylum: Archamoebae (chaos, pelomyxa, mastigina)
  - Infraphylum: Mycetozoa (Haeckel 1904)
    - Classis: Eumycetozoa (verus fungus mucidus)
    - Subclassis: Myxogastria (olim: Myxomycetes / Myxomycota, plasmodialis fungus mucidus), Dictyo-/ & Protostelia/-ida?)
      - Ordo: Physariida
        Familia: Physaridae (fuligo)
    - Classis: Acrasiomycetes (cellularis fungus mucidus)
    - Subclassis: Euplasmodida

Subregnum: Corticata (Lankester 1878)
(=Archaeplastida & Chromalveolata, Excavata & Rhizaria = Cabozoa C.Smith)
(Subregnum: Biciliata (=Biconta?)
(Subregnum: (A)dictyozoa (Cavalier-Smith 1991) // Neozoa
- Infraregnum / Superphylum Alveolata (Cavalier-Smith, 1991): Endoymbiosis!
  - Phylum: Apicomplexa
    - Classis: Sporozoa (plasmodium)
  - Phylum: Ciliophora / Ciliata
    - Classis: Oligohymenophorea (paramecium)
Infraregnum: Excavata (qui cystostomam (cavum vel sulcum ventralem) habent, Cavalier-Smith, 2003)
- Superphylum: Discicristata
  - (Sub)Phylum: Percolozoa
  - (Sub)Phylum: Euglenozoa (Cavalier-Smith, 1981) // Euglenophyta
    - Classes: Euglenida, Cinetoplastea (Honigberg, 1963)
  - Phylum: Metamonada
  - Subphylum: Anaeromonada, Classis: Anaeromonadea (Ordo: Oxymonadida)
  - Subphylum: Trichozoa CS1997), Ramus: Parabasalia (Honigberg, 1973 / Cavalier-Smith, 2003)
  - Infraregnum / Phylum: Rhizaria (Cavalier-Smith, 1987/2002)
    - Subclassis: Actinopoda (protista amoeboides cum testis)
      - Ordo: Apusozoa (Apusomonadida, Ancyromonadida & Hemimastigida, Cavalier-Smith 1997, 2002/3)
      - Ordo: Cercozoa
      - Ordo: Foraminifera (Retaria?)
      - Ordo: Heliozoa, Radiolaria

Regnum: Chromista

Regnum: Chromista (Cavalier-Smith 1981) // Chromalveolata (?)
- Infraregnum: Chromobionta / Phylum: Heteroconta / Stramenopila (Cavalier-Smith, 1986)
  - Phylum Heterocontophyta (=Phaeophyta / Fucophyta: fucus)
  - Phylum Chrysophyta (Bacillariophyceae: Diatomae (algae silicatae)
  - Phylum Oomycetes (fungus aquatilis), Cavalier-Smith, 1981)
  - Phylum Cryptomonadida (algae minutissimae biflagellatae)
  - Phylum Haptophyta (algae calcariae)
  - Phylum Chromophyta / Ochrophyta (?), Xanthophyta (?)
- Supergrex: Archaeplastida (Adl &al. 2005) / Primoplantae (Palmer &al. 2004)
  - Phyla: Rhodophyta, Glaucophyta (algae) // Chlorophyta, Embryophyta (plantae)

Regnum: Fungi

Regnum: Fungi / Mycota (fungus)
- Divisio / Subregnum: Myxomycota (vide et amoebozoa)
- Divisio / Subregnum: Eumycota
  - Divisio (Phylum): Basidiomycota
    - Classis: Basidiomycetes / Agaricomycetes / Hymenomycetes (?)
    - Subclassis: Agaricomycetidae
      - Ordo: Agaricales (agaricus)
      - Ordo: Boletales (boletus)
  - Divisio (Phylum): Euascomycota (multi fungi filamentosi)
  - Divisio (Phylum): Ascomycota / Pezizomycota
  - Subdivisio: Ascomycotina / Pezizomycotina
    - Classis: Ascomycetes / Pezizomycetes
      - Ordo: Pezizales (morchella, tuber)
    - Classis: Eurotiomycetes (?)
    - Subclassis: Eurotiomycetidae
      - Ordo: Eurotiales
        Familie: Trichocomaceae (aspergillus, penicillium)
  - Subdivisio: Saccharomycotina
  - Divisio (Phylum): Zygomycota

Regnum: Plantae

Regnum: Plantae / Vegetabilia
(Subregnum / (Gradus: Protophyta (algae & Heterocontophyta vide supra)
Subregnum: Metabionta // Histonia (Haeckel 1904)
Infraregnum / Superdivisio: Embryophyta
- (Super)Divisio: Bryophyta (musci)
  - Divisio: Pteridophyta (filices)
    - Classis: Pteridopsida
      - Ordo: Cyatheales (filices arborescentes)
        Familia: Cyatheaceae
        
        Familia: Dicksoniaceae
  - Divisio: Lycophyta / Lycopodiophyta
    - Classis: Selaginellopsida
      - Ordo: Selaginellales (Selaginella)
  - Subdivisio: Lycophytina (lycopodium)
- (Super)Divisio: Spermatophyta
  - Divisio: Gymnospermae (Coniferophytina / Pinophyta)
  - Subdivisio: Cycadophytina
  - Subdivisio: Gnetophytina
  - Subdivisio: Ginkgophytina
  - Subdivisio: Pinophytina
    - Classis: Pinopsida (?)
      - Ordo: Pinales
        Familia: Araucariaceae
        
        Familia: Cupressaceae
        
        Familia: Pinaceae (abies, Pinus)
        
        Familia: Podocarpaceae
        
        Familia: Taxaceae (taxus)
- Divisio: Angiospermae (Magnoliophyta)
  - Subdivisio: Magnoliophytina
    - Classis: Monocotyledonae (Liliopsida / Liliatae)
    - Subclassis: Liliidae
      - (Superdordo: Commeliniflorae / Bromeliiflorae (?)
      - Ordo: Asparagales (asparagus)
      - Ordo: Dioscoreales (batata)
      - Ordo: Liliales (lilium, tulipa)
      - Ordo: Nymphaeales (lotos)
      - Ordo: Orchidales (Orchis)
      - Ordo: Pandanales
      - Ordo: Poales (gramen, bambusa)
    - Subclassis: Zingiberidae
      - Superordo: Zingiberiflorae
      - Ordo: Zingiberales (zingiber)
        Familia: Bromeliaceae (Ananas)
    - Classis: Dicotyledonae (Magnoliopsida / Magnoliatae)
    - Subclassis: Asteridae
      - Ordo: Asterales (chrysanthemum)
      - Ordo: Campanulales
      - Ordo: Ericales (Rhododendron)
        Familia: Actinidiaceae (Actinidia)
        
        Familia: Sapotaceae
        
        Familia: Balsaminaceae (impatiens)
      - Ordo: Gentianales
        Familia: Apocynaceae
      - Ordo: Lamiales (Ocimum basilicum, Mentha, Salvia)
      - Ordo: Rubiales
        Familia: Rubiaceae (Coffea)
      - Ordo: Scrophulariales
      - Ordo: Solanales
        Familia: Solanaceae (Lycopersicon, Capsicum, Solanum tuberosum)
    - Subclassis: Caryophyllidae
      - Ordo: Caryophyllales
        Familia: Aizoaceae
        
        Familia: Amaranthaceae (spinacia)
        
        Familia: Basellaceae (basella)
        
        Familia: Cactaceae (cactus, opuntia)
        
        Familia: Caryophyllaceae
        
        Familia: Chenopodiaceae
        
        Familia: Nyctaginaceae
        
        Familia: Phytolaccaceae
        
        Familia: Portulacaceae
      - Ordo: Polygonales
      - Ordo: Plumbaginales
    - Subclassis: Dilleniidae
      - Ordo: Guttiferales / Parietales
        Familia: Clusiaceae (hypericum)
      - Ordo: Begoniales
      - Ordo: Caricales
      - Ordo: Capparales (capparis)
        Familia: Cruciferae / Brassicaceae (raphanus)
      - Ordo: Dilleniales
      - Ordo: Ebenales (diospyrus)
      - Ordo: Ericales (Calluna, Vaccinum)
      - Ordo: Malvales
      - Ordo: Moringales
      - Ordo: Nepenthales
      - Ordo: Passiflorales
      - Ordo: Primulales
      - Ordo: Salicales (Salix)
      - Ordo: Tamariscales
      - Ordo: Theales (Thea)
      - Ordo: Violales (viola)
        Familia: Flacourtiaceae
        
        Familia: Tamariscaceae?
    - Subclassis: Hamamelidae
      - Superordo: Hamamelidanae
      - Ordo: Fagales
        Familia: Betulaceae (alnus, castanea, corylus)
      - Ordo: Urticales
        Familia: Moraceae (morus)
    - Subclassis: Magnoliidae
      - Superordo: Magnolianae / Magnoliiflorae (?)
      - Ordo: Laurales (laurus, cinnamomum, persea)
      - Ordo: Magnoliales
      - Subordo: Magnoliineae
        Familia: Magnoliaceae
        
        Subfamilia: Magnolioideae
        Tribus: Magnolieae
        
        Subtribus: Magnoliinae
        Genus: Magnolia
      - Ordo: Papaverales (Papaver)
      - Ordo: Piperales (piper)
      - Ordo: Ranunculales (anemona)
    - Subclassis: Rosidae
      - Superordo: Aralianae
      - Ordo: Apiales
        Familia: Araliaceae
        
        Familia: Apiaceae
      - Ordo: Araliales
        Familia: Araliaceae
        
        Familia: Hydrocotylaceae
        
        Familia: Apiaceae (apium, daucus, allium, porrum)
      - Ordo: Dipsacales (valeriana)
        Familia: Caprifoliaceae
        
        Familia: Dipsacaceae
      - Superordo: Celastranae (Disciflorae)
      - Ordo: Aquifoliales
      - Ordo: Celastrales
      - Superordo: Cornanae
      - Ordo: Fabales (faba)
      - Ordo: Geraniales (geranium)
      - Ordo: Hydrangeales
      - Ordo: Cornales
        Familia: Alangiaceae
        
        Familia: Nyssoideae
      - Superordo: Rosanae
      - Ordo: Celastrales
      - Ordo: Euphorbiales (ricinus)
      - Ordo: Fabales (Leguminosae)
      - Ordo: Geraniales
      - Ordo: Myrtales
        Familia: Myrtaceae (eucalyptus, murtus, syzygium)
        
        Familia: Onagraceae
      - Ordo: Rhamnales (rhamnus)
      - Ordo: Rhizophorales
      - Ordo: Rosales (rosa, rubus, prunus, pyrus, cerasus, fragaria)
      - Ordo: Santalales (santalum)
      - Ordo: Sapindales
        Familia: Rutaceae (citrus)
      - Ordo: Saxifragales
      - Subordo: Saxifragineae
        Familia: Crassulaceae
        
        Familia: Grossulariaceae (ribes)
      - Ordo: Thymeleales
      - Subordo: Vitineae
        Familia: Vitaceae (vitis / uva)

Regnum: Animalia

Regnum: Animalia
(Sub)Regna "Archezoa, Protozoa" vide supra)
Subregnum (Gradus?): Metazoa, Metabionta (qui plures cellulas habent (Histonia Haeckel 1904)
Infraregnum: Epitheliozoa (qui tegumentum habent?)
- Parvregnum: Parazoa (qui tela carent)
  - Phylum: Porifera / Spongiaria
  - Subphylum: Cellularia
    - Classis: Demospongiae (spongia)
(Infraregnum: Eucoelomata (qui cavum intra corpus habent: Annelida, Arthropoda, Brachiopoda, Bryozoa)
Parvregnum (Subgradus): Eumetazoa / Histozoa (qui telam cellulosam habent: Cnidaria, Ctenophora)
- Superramus: Acrosomata (qui spermio similes sunt?)
- Ramus (Subregnum / Superphylum?): Radiata /-alia: (Diploblastica?)
  - Phylum: Coelenterata / Cnidaria?
    - Classis: Hydrozoa (hydra)
    - Classis: Scyphozoa (medusa)
  - Classis: Anthozoa (corallium, anemona)
- Phylum: Echinodermata
- Subphylum: Echinozoa
  - Classis: Echinoidea (echinus marinus)
  - Classis: Holothuroidea
- Ramus: Bilateria /-alia: (qui duae partes corporis aequales habent, Triploblastica?)
- Subramus: Nephrozoa, Eucoelomata (?)
  - Superphylum (Cladus): Protostomia (qui primo orificio ore utuntur: Annelidae, Arthropoda, Mollusca)
  - Phylum: Mollusca
    - Classis: Gastropoda (cochlea & limax)
    - Classis: Cephalopoda (sepia & octopus)
  - Phylum: Annelida
    - Classis: Sipunculida
    - Classis: Polychaeta (vermis marinus)
    - Classis: Oligochaeta
      - Familia: Lumbricidae (lumbricus)
    - Classis: Hirudinea
      - Familia: Hirudinidae (hirudo)
  - Phylum: Arthropoda
  - Subphylum: Chelicerata
    - Classis: Arachnida
    - Subclassis: Acarina / Acari
      - Superordo: Parasitiformes
      - Ordo: Ixodida
  - Subphylum: Crustacea
    - Classis: Malacostraca
      - Ordo: Decapoda
      - Subordo: Macrura (cammarus, locusta marina)
      - Subordo: Brachyura (cancer)
    - Classis: Trilobita
    - Classis: Merostomata / Palaeostraca
      - Ordo: Xiphosura (?)
    - Classis: Arachnida (aranea)
      - Ordo: Scorpionida (scorpio)
    - Classis: Myriopoda (centipes & scolopendra)
    - Classis: Insecta
      - Ordo: Blattodea (blatta)
      - Ordo: Odonata (libella & libellula)
      - Ordo: Isoptera (termes)
      - Ordo: Orthoptera (locusta & gryllus)
      - Ordo: Homoptera (cicada & aphis)
      - Ordo: Hemiptera (cimex)
      - Ordo: Coleoptera (scarabaeus)
      - Ordo: Hymenoptera (apis & formica)
      - Ordo: Diptera (muscae)
      - Ordo: Siphonaptera / Aphaniptera (pulex)
      - Ordo: Lepidoptera (papilio)
  - Superphylum (Gradus / Cladus): Deuterostomia (Echinodermata, Chordata)
  - Phylum: Echinodermata
    - Classis: Asteroidea (?)
  - (Superphylum / Infraregnum?: Chordonia)
  - Phylum: Chordata
  - Subphylum: Notochordata?
  - (Infraphylum: Craniota?
  - (Parvphylum: Vertebrata / Myopterygia?
  - (Infimphylum (Cladus): Gnathostomata)
  - (Subcladus: Osteognathostomata
  - (Parvcladus: Choanata (?)
    - (Series: Chondrichthiomorphi?)
    - Classis: Chondrichthyes, Chondrostei (?)
    - Subclassis: Elasmobranchii (selachus, raia)
    - Subclassis: Holocephali (chimaeras)
    - Superclassis (Series): Osteichthyes (Pisces)
    - Classis: Sarcopterygii / Choanichthyes
    - Subclassis / Ordo: Crossopterygii / Coelacanthimorpha (Actinista)
    - Subclassis / Ordo: Dipnoi
    - Classis: Actinopterygii (piscis)
    - Subclassis: Teleostei
      - Ordo: Anguilliformes (anguilla)
      - Ordo: Clupeiformes (clupea, harengus?)
      - Ordo: Cypriniformes (cyprinus)
      - Ordo: Siluriformes (silurus)
      - Ordo: Perciformes (perca)
  - (Series / Superclassis?: Tetrapoda
  - (Subseries / Infraclassis?: Amphibia // Amniota
    - Classis: Amphibia
      - Ordo: Salienta (rana & bufo)
      - Ordo: Caudata (salamandra)
    - Classis: Reptilia (diapsida)
      - Ordo: Saurischida (olim: Dinosauria)
      - Ordo: Squamata (lacerta)
      - Ordo: Ophidia (serpens)
      - Ordo: Crocodylia (crocodylus)
      - Ordo: Testudinata (testudo) (anapsida)
    - Classis: Aves (diapsida)
      - Ordo: Struthioniformes (struthio)
      - Ordo: Ciconiformes (ciconia)
      - Ordo: Anseriformes (anas, anser, cygnus)
      - Ordo: Falconiformes (falco)
        Familia: Accipitridae (aquila, vultur)
      - Ordo: Galliformes (phasianus, pavo)
      - Ordo: Passeriformes
        Familia: Passeridae (passer)
        
        Familia: Hirundinidae (hirundo)
        
        Familia: Sturnidae (sturnus)
        
        Familia: Corvidae (cornix, pica)
        
        Familia: Fringillidae (fringilla)
      - Ordo: Piciformes
        Familia: Picidae (picus)
    - Classis: Mammalia (diapsida)
    - Subclassis: Theria
    - Infraclassis: Prototheria
      - Subordo: Monotremata / Platypoda
        Familia: Ornithorhynchidae
    - Infraclassis: Metatheria / Marsupialia
    - Infraclassis: Eutheria / Monodelphia / Placentalia
      - Ordo: Diprotodontia
        Familia: Diadelphidae (opossum?)
        
        Familia: Phascolarctidae (koala?)
      - Superordo: Euarchontoglires / Supraprimates
      - Ordo: Chiroptera (vespertilio)
      - Ordo: Carnivora
        Familia: Canidae (lupus, canis, vulpes)
        
        Familia: Felidae (feles/felis, tigris, leo, panthera etc.)
        
        Familia: Ursidae (ursus)
      - Ordo: Cetacea (balaena)
      - Ordo: Proboscidea (elephas)
      - Ordo: Perissodactyla (equus etc.)
      - Ordo: Artiodactyla
        Familia: Suidae (sus)
        
        Familia: Camelidae (camelus)
        
        Familia: Cervidae (cervus)
        
        Familia: Bovidae (bos)
      - Ordo: Rodentia (sciurus & mus)
      - Ordo: Lagomorpha (lepus)
      - Ordo: Primates (simia & macaca)
      - Subordo: Haplorrhini
      - Infraordo: Anthropoidea
      - Parvordo: Catarrhini
        Superfamilia: Hominoidea
        
        Familia: Hominidae
        
        Subfamilia: Homininae (afric.), Ponginae (asiat.)
        Tribus: Hominini
        
        Subtribus: Hominina
        Genus: Homo
        Species: Homo sapiens

Notae

↑ ""Biota" apud WoRMS. L. Margulis et K. V. Schwartz, Five Kingdoms: an illustrated guide to the phyla of life on earth, tertia ed. (Novi Eboraci: Freeman, 1998). ISBN 0-7167-3027-8.
↑ Anglice "Panbiota": the first ancestor of Homo sapiens and all of its descendants.
↑ Oxford English Dictionary (3a editio, 2010), s.v. "biota".
↑ ARCHOKARYOTA (URKERNTR+äGER) apud www.sthco.de^{[nexus deficit]}
↑ Woese CR, Kandler O, Wheelis ML (1990). "Towards a natural system of organisms: proposal for the domains Archaea, Bacteria, and Eucarya". Proc Natl Acad Sci U S A 87 (12): 4576–9

Bibliographia

Michael A. Ruggiero et al., "A Higher Level Classification of All Living Organisms" in PLOS One (29 Aprilis 2015)
Kevin de Queiroz, Philip D. Cantino, Jacques A. Gauthier, Phylonyms: A Companion to the PhyloCode (CRC Press, 2020)
J. R. Wagner, "The general case of phylogenetic definitions, alternate classes of definitions, and the phylogenetic definition of Life (with a capital L)" in Michel Laurin et al, edd., First International Phylogenetic Nomenclature Meeting 8 (2004)
Walton, Lee Barker. "Studies Concerning Organisms Occuring in Water Supplies With Particular Reference to Those Founded in Ohio" in Ohio Biological Survey Bulletin, 24 (1930), pp.1-86.

Nexus interni

Abiogenesis

Nexus externi

Situs scientifici: • Encyclopedia of Life • WoRMS: Marine Species • Fossilworks

Fungus micidus

[1] ""Biota" apud WoRMS. L. Margulis et K. V. Schwartz, Five Kingdoms: an illustrated guide to the phyla of life on earth, tertia ed. (Novi Eboraci: Freeman, 1998). ISBN 0-7167-3027-8.

[2] Anglice "Panbiota": the first ancestor of Homo sapiens and all of its descendants.

[3] Oxford English Dictionary (3a editio, 2010), s.v. "biota".

[4] ARCHOKARYOTA (URKERNTR+äGER) apud www.sthco.de^{[nexus deficit]}

[5] Woese CR, Kandler O, Wheelis ML (1990). "Towards a natural system of organisms: proposal for the domains Archaea, Bacteria, and Eucarya". Proc Natl Acad Sci U S A 87 (12): 4576–9

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]