CASZ1

CASZ1
Ідентифікатори
Символи	CASZ1, CAS11, CST, SRG, ZNF693, dJ734G22.1, castor zinc finger 1
Зовнішні ІД	OMIM: 609895 MGI: 1196251 HomoloGene: 9824 GeneCards: CASZ1
Онтологія гена Молекулярна функція • зв’язування з іоном металу • зв'язування з ДНК • зв'язування з нуклеїновими кислотами • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • внутрішньоклітинна мембранна органела • нуклеоплазма • гіалоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • розвиток багатоклітинного організму • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of neuron differentiation • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • ДНК-матрична транскрипція • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 регуляція транскрипції РНК-полімеразою II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54897	69743
Ensembl	ENSG00000130940	ENSMUSG00000028977
UniProt	Q86V15	Q9CWL2
RefSeq (мРНК)	NM_001039183 NM_001079843 NM_017766	NM_001159344 NM_027195
RefSeq (білок)	NP_001073312 NP_060236	NP_001152816 NP_081471
Локус (UCSC)	Хр. 1: 10.64 – 10.8 Mb	Хр. 4: 148.89 – 149.04 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CASZ1 (англ. Castor zinc finger 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 759 амінокислот, а молекулярна маса — 190 069.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDLGTAEGTR		CTDPPAGKPA		MAPKRKGGLK		LNAICAKLSR		QVVVEKRADA
GSHTEGSPSQ		PRDQERSGPE		SGAARAPRSE		EDKRRAVIEK		WVNGEYSEEP
APTPVLGRIA		REGLELPPEG		VYMVQPQGCS		DEEDHAEEPS		KDGGALEEKD
SDGAASKEDS		GPSTRQASGE		ASSLRDYAAS		TMTEFLGMFG		YDDQNTRDEL
ARKISFEKLH		AGSTPEAATS		SMLPTSEDTL		SKRARFSKYE		EYIRKLKAGE
QLSWPAPSTK		TEERVGKEVV		GTLPGLRLPS		STAHLETKAT		ILPLPSHSSV
QMQNLVARAS		KYDFFIQKLK		TGENLRPQNG		STYKKPSKYD		LENVKYLHLF
KPGEGSPDMG		GAIAFKTGKV		GRPSKYDVRG		IQKPGPAKVP		PTPSLAPAPL
ASVPSAPSAP		GPGPEPPASL		SFNTPEYLKS		TFSKTDSITT		GTVSTVKNGL
PTDKPAVTED		VNIYQKYIAR		FSGSQHCGHI		HCAYQYREHY		HCLDPECNYQ
RFTSKQDVIR		HYNMHKKRDN		SLQHGFMRFS		PLDDCSVYYH		GCHLNGKSTH
YHCMQVGCNK		VYTSTSDVMT		HENFHKKNTQ		LINDGFQRFR		ATEDCGTADC
QFYGQKTTHF		HCRRPGCTFT		FKNKCDIEKH		KSYHIKDDAY		AKDGFKKFYK
YEECKYEGCV		YSKATNHFHC		IRAGCGFTFT		STSQMTSHKR		KHERRHIRSS
GALGLPPSLL		GAKDTEHEES		SNDDLVDFSA		LSSKNSSLSA		SPTSQQSSAS
LAAATAATEA		GPSATKPPNS		KISGLLPQGL		PGSIPLALAL		SNSGLPTPTP
YFPILAGRGS		TSLPVGTPSL		LGAVSSGSAA		SATPDTPTLV		ASGAGDSAPV
AAASVPAPPA		SIMERISASK		GLISPMMARL		AAAALKPSAT		FDPGSGQQVT
PARFPPAQVK		PEPGESTGAP		GPHEASQDRS		LDLTVKEPSN		ESNGHAVPAN
SSLLSSLMNK		MSQGNPGLGS		LLNIKAEAEG		SPAAEPSPFL		GKAVKALVQE
KLAEPWKVYL		RRFGTKDFCD		GQCDFLHKAH		FHCVVEECGA		LFSTLDGAIK
HANFHFRTEG		GAAKGNTEAA		FPASAAETKP		PMAPSSPPVP		PVTTATVSSL
EGPAPSPASV		PSTPTLLAWK		QLASTIPQMP		QIPASVPHLP		ASPLATTSLE
NAKPQVKPGF		LQFQENDPCL		ATDCKYANKF		HFHCLFGNCK		YVCKTSGKAE
SHCLDHINPN		NNLVNVRDQF		AYYSLQCLCP		NQHCEFRMRG		HYHCLRTGCY
FVTNITTKLP		WHIKKHEKAE		RRAANGFKYF		TKREECGRLG		CKYNQVNSHF
HCIREGCQFS		FLLKHQMTSH		ARKHMRRMLG		KNFDRVPPSQ		GPPGLMDAET
DECMDYTGCS		PGAMSSESST		MDRSCSSTPV		GNESTAAGNT		ISMPTASGAK
KRFWIIEDMS		PFGKRRKTAS		SRKMLDEGMM		LEGFRRFDLY		EDCKDAACQF
SLKVTHYHCT		RENCGYKFCG		RTHMYKHAQH		HDRVDNLVLD		DFKRFKASLS
CHFADCPFSG		TSTHFHCLRC		RFRCTDSTKV		TAHRKHHGKQ		DVISAAGFCQ
FSSSADCAVP		DCKYKLKCSH		FHCTFPGCRH		TVVGMSQMDS		HKRKHEKQER
GEPAAEGPAP		GPPISLDGSL		SLGAEPGSLL		FLQSAAAGLG		LALGDAGDPG
PPDAAAPGPR		EGAAAAAAAA		GESSQEDEEE		ELELPEEEAE		DDEDEDDDED
DDDEDDDEDD		DDEDLRTDSE		ESLPEAAAEA		AGAGARTPAL		AALAALGAPG
PAPTAASSP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Liu Z., Yang X., Tan F., Cullion K., Thiele C.J. (2006). Molecular cloning and characterization of human Castor, a novel human gene upregulated during cell differentiation. Biochem. Biophys. Res. Commun. 344: 834—844. PMID 16631614 doi:10.1016/j.bbrc.2006.03.207
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1