RERE

RERE
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2YQK
Ідентифікатори
Символи	RERE, ARG, ARP, ATN1L, DNB1, arginine-glutamic acid dipeptide repeats, NEDBEH
Зовнішні ІД	OMIM: 605226 MGI: 2683486 HomoloGene: 8101 GeneCards: RERE
Пов'язані генетичні захворювання
вітиліго, neurodevelopmental disorder with or without anomalies of the brain, eye, or heart
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001105 transcription coactivator activity • sequence-specific DNA binding • зв'язування з ДНК • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • зв'язування з іонами цинку • chromatin binding • зв’язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми • poly-glutamine tract binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • histone deacetylase complex • клітинне ядро Біологічний процес • ремоделювання хроматину • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • dendrite morphogenesis • cerebellar Purkinje cell layer maturation • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • ДНК-матрична транскрипція • cerebellum development • branching morphogenesis of a nerve • cerebellar granule cell precursor proliferation • розвиток багатоклітинного організму • radial glia guided migration of Purkinje cell • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • NLS-bearing protein import into nucleus • transcription by RNA polymerase II • negative regulation of nucleic acid-templated transcription • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 регуляція транскрипції РНК-полімеразою II • positive regulation of nucleic acid-templated transcription Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	473	68703
Ensembl	ENSG00000142599	ENSMUSG00000039852
UniProt	Q9P2R6	Q80TZ9
RefSeq (мРНК)	NM_001042681 NM_001042682 NM_012102	NM_001085492
RefSeq (білок)	NP_001036146 NP_001036147 NP_036234	NP_001078961
Локус (UCSC)	Хр. 1: 8.35 – 8.85 Mb	Хр. 4: 150.28 – 150.62 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RERE (англ. Arginine-glutamic acid dipeptide repeats) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 566 амінокислот, а молекулярна маса — 172 424.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTADKDKDKD		KEKDRDRDRD		REREKRDKAR		ESENSRPRRS		CTLEGGAKNY
AESDHSEDED		NDNNSATAEE		STKKNKKKPP		KKKSRYERTD		TGEITSYITE
DDVVYRPGDC		VYIESRRPNT		PYFICSIQDF		KLVHNSQACC		RSPTPALCDP
PACSLPVASQ		PPQHLSEAGR		GPVGSKRDHL		LMNVKWYYRQ		SEVPDSVYQH
LVQDRHNEND		SGRELVITDP		VIKNRELFIS		DYVDTYHAAA		LRGKCNISHF
SDIFAAREFK		ARVDSFFYIL		GYNPETRRLN		STQGEIRVGP		SHQAKLPDLQ
PFPSPDGDTV		TQHEELVWMP		GVNDCDLLMY		LRAARSMAAF		AGMCDGGSTE
DGCVAASRDD		TTLNALNTLH		ESGYDAGKAL		QRLVKKPVPK		LIEKCWTEDE
VKRFVKGLRQ		YGKNFFRIRK		ELLPNKETGE		LITFYYYWKK		TPEAASSRAH
RRHRRQAVFR		RIKTRTASTP		VNTPSRPPSS		EFLDLSSASE		DDFDSEDSEQ
ELKGYACRHC		FTTTSKDWHH		GGRENILLCT		DCRIHFKKYG		ELPPIEKPVD
PPPFMFKPVK		EEDDGLSGKH		SMRTRRSRGS		MSTLRSGRKK		QPASPDGRTS
PINEDIRSSG		RNSPSAASTS		SNDSKAETVK		KSAKKVKEEA		SSPLKSNKRQ
REKVASDTEE		ADRTSSKKTK		TQEISRPNSP		SEGEGESSDS		RSVNDEGSSD
PKDIDQDNRS		TSPSIPSPQD		NESDSDSSAQ		QQMLQAQPPA		LQAPTGVTPA
PSSAPPGTPQ		LPTPGPTPSA		TAVPPQGSPT		ASQAPNQPQA		PTAPVPHTHI
QQAPALHPQR		PPSPHPPPHP		SPHPPLQPLT		GSAGQPSAPS		HAQPPLHGQG
PPGPHSLQAG		PLLQHPGPPQ		PFGLPPQASQ		GQAPLGTSPA		AAYPHTSLQL
PASQSALQSQ		QPPREQPLPP		APLAMPHIKP		PPTTPIPQLP		APQAHKHPPH
LSGPSPFSMN		ANLPPPPALK		PLSSLSTHHP		PSAHPPPLQL		MPQSQPLPSS
PAQPPGLTQS		QNLPPPPASH		PPTGLHQVAP		QPPFAQHPFV		PGGPPPITPP
TCPSTSTPPA		GPGTSAQPPC		SGAAASGGSI		AGGSSCPLPT		VQIKEEALDD
AEEPESPPPP		PRSPSPEPTV		VDTPSHASQS		ARFYKHLDRG		YNSCARTDLY
FMPLAGSKLA		KKREEAIEKA		KREAEQKARE		EREREKEKEK		ERERERERER
EAERAAKASS		SAHEGRLSDP		QLSGPGHMRP		SFEPPPTTIA		AVPPYIGPDT
PALRTLSEYA		RPHVMSPTNR		NHPFYMPLNP		TDPLLAYHMP		GLYNVDPTIR
ERELREREIR		EREIRERELR		ERMKPGFEVK		PPELDPLHPA		ANPMEHFARH
SALTIPPTAG		PHPFASFHPG		LNPLERERLA		LAGPQLRPEM		SYPDRLAAER
IHAERMASLT		SDPLARLQMF		NVTPHHHQHS		HIHSHLHLHQ		QDPLHQGSAG
PVHPLVDPLT		AGPHLARFPY		PPGTLPNPLL		GQPPHEHEML		RHPVFGTPYP
RDLPGAIPPP		MSAAHQLQAM		HAQSAELQRL		AMEQQWLHGH		PHMHGGHLPS
QEDYYSRLKK		EGDKQL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

• Hou R., Sibinga N.E. (2009). Atrophin proteins interact with the Fat1 cadherin and regulate migration and orientation in vascular smooth muscle cells. J. Biol. Chem. 284: 6955—6965. PMID 19131340 doi:10.1074/jbc.M809333200
• Waerner T., Gardellin P., Pfizenmaier K., Weith A., Kraut N. (2001). Human RERE is localized to nuclear promyelocytic leukemia oncogenic domains and enhances apoptosis. Cell Growth Differ. 12: 201—210. PMID 11331249

Див. також

• Хромосома 1